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利用python如何处理nc数据详解

2018年05月29日  | 移动技术网IT编程  | 我要评论

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前言

这两天帮一个朋友处理了些 nc 数据,本以为很简单的事情,没想到里面涉及到了很多的细节和坑,无论是“知难行易”还是“知易行难”都不能充分的说明问题,还是“知行合一”来的更靠谱些,既要知道理论又要知道如何实现,于是经过不太充分的研究后总结成此文,以记录如何使用 python 处理 nc 数据。

一、nc 数据介绍

nc 全称 netCDF(The Network Common Data Form),可以用来存储一系列的数组,就是这么简单(参考 是 Mapbox 开源的空间数据处理框架,功能非常强大,此处不细说,只表如何处理我们的 nc 数据。

当然第一种方式就是使用 netCDF4 处理完之后,使用此框架写入 GeoTiff,但是这样不太优雅,而且使用了两个框架,明显过于麻烦,我们直接使用此框架从读数据开始处理。

此处读的时候就有技巧了,要像采用 gdalinfo 读取 SUBDATASET 一样来直接读取此 SUBDATASET 数据,如下:

with rio.open('NETCDF:name.nc:SUBDATASET_NAME') as src:
 print(src.meta)
 dim = int(src.meta['count'])
 src.read(range(1, dim + 1))

即给 open 函数传入 NETCDF:name.nc:SUBDATASET_NAME,采用 src.read(range(1, dim + 1)) 可以直接读出此范围内所有 Band (时间点)的信息,范围可以自己设定,注意从 0 开始,当然也可以仅读取某个 Band 的信息。

src.meta 记录了此 SUBDATASET 的元数据信息,与 gdalinfo 看到的基本相同。

这样我们就可以继续将此数据使用 numpy 等框架进行处理,处理完之后更重要的是要写入 GeoTiff 中(直白的说就是添加空间信息)。

也很简单,如下即可:

with rio.open(newfile, 'w', **out_meta) as dst:
 dst.write_band(1, res_arr)

newfile 为存储路径,res_arr 为计算结果数组,注意尺寸不要发生变化(width*height),out_meta 为目标文件的元数据描述信息,可以直接将上面 src.meta 进行简单处理即可。

out_meta = 
 meta.update({"driver": "GTiff",
   "dtype": "float32",
   'count': 1,
   'crs': 'Proj4: +proj=longlat +datum=WGS84 +no_defs',
   'transform': rasterio.transform.from_bounds(west, south, east, north, width, height)
  })

crs 表示目标数据空间投影信息,transform 表示目标文件 空间范围信息,可以通过经纬度信息和图像尺寸等计算得到。

dst.write_band 将数据写入对应波段,当然此处也可以写入多个波段,根据计算结果而定,同样从 1 开始。

三、总结

本文简单介绍了 nc 数据的特点及如何使用 python 处理 nc 数据。每个目标都有多条路可以达到,重要的是找到那条自己喜欢的和适合自己的路,然而话又说回来,即使走的不是想要的那条路,不是一样可以达到目标嘛!所以关键是要找到自己的目标。

好了,以上就是这篇文章的全部内容了,希望本文的内容对大家的学习或者工作具有一定的参考学习价值,如果有疑问大家可以留言交流,谢谢大家对移动技术网的支持。

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